شبپره مینوز گوجه فرنگی، Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera: Gelechiidae) یک آفت بسیار مخرب در محصولات گوجه فرنگی و سیب زمینی است. در این مقاله، جمعیت های باکتری در تخمها، کل بدن و اندامهای مختلف لاروهای سنین چهارم در دو جمعیت کرج و رشت جداسازی و شناسایی شدند. با استفاده از پرایمر 16S rRNA همه همزیستهای باکتریایی قابل کشت و غیرقابل کشت در دو شاخه Proteobacteria , Firmicutes طبقه بندی شدند. تجزیه و تحلیل با BLASTn همپوشانی جنس های Wolbachia, Enterobacter, Psedomonas, Staphylococcus و Acinetobacter در دو جمعیت را نشان داد. اما Bacillus subtilis و Serratia marcescens در جمعیت شهرستان رشت و Paenibacillus sp. و Pasadenensis Paenibacillus در جمعیت شهرستان کرج شناسایی شد. تجزیه و فیلوژنتیکی تمامی توالی های باکتریایی به جز Wolbachia یک سیر تکاملی بین همزیستهای برگخوار و دیگر بالپولکداران را نشان داد. علاوه بر این، این پژوهش کشف روش های جدیدی را برای کنترل زیستی آفت Tuta absoluta بر اساس رابطه انگلی یا همزیستی دوجانبه را ارائه خواهد کرد.